• facebook
  • linkedin
  • youtube

Matapos pormal na iminungkahi ng Amerikanong iskolar na si Eric S. Lander ang solong nucleotide polymorphism (SNP) bilang ikatlong henerasyong molecular marker noong 1996, malawakang ginagamit ang SNP sa pagsusuri ng economic trait association, biological genetic linkage map construction, at human pathogenic gene screening., Diagnosis at paghula sa panganib sa sakit, indibidwal na pagsusuri sa gamot, at iba pang larangan ng biolohikal at medikal na pananaliksik.Sa larangan ng pag-aanak ng cash crop, ang pagtuklas ng SNP ay maaaring mapagtanto ang maagang pagpili ng mga kinakailangang katangian.Ang pagpili na ito ay may mga katangian ng mataas na katumpakan at maaaring epektibong maiwasan ang pagkagambala ng morpolohiya at kapaligiran na mga kadahilanan, sa gayon ay lubos na nagpapaikli sa proseso ng pag-aanak.Samakatuwid, ang SNP ay gumaganap ng malaking papel sa larangan ng pangunahing pananaliksik.

Ang Single Nucleotide Polymorphism (Single Nucleotide Polymorphism, SNP) ay tumutukoy sa kababalaghan na may mga solong pagkakaiba sa nucleotide sa parehong posisyon sa pagkakasunud-sunod ng DNA ng mga indibidwal ng pareho o ibang species.Ang pagpasok, pagtanggal, conversion at pagbabaligtad ng isang base ay maaaring maging sanhi ng pagkakaibang ito.Sa nakaraan, ang kahulugan ng SNP ay iba sa mutation.Ang isang variant locus ay nangangailangan na ang dalas ng isa sa mga alleles sa populasyon ay higit sa 1% upang matukoy bilang isang SNP locus.Gayunpaman, sa pagpapalawak ng mga modernong teoryang biyolohikal at paggamit ng teknolohiya, ang dalas ng allele ay hindi na isang kinakailangang kondisyon upang limitahan ang kahulugan ng SNP.Ayon sa solong data ng pagkakaiba-iba ng nucleotide na kasama sa database ng Single Nucleotide Polymorphisms (dbSNP) sa ilalim ng National Center for Biotechnology Information (NCBI), kasama rin ang low-frequency insertion/deletion, microsatellite variation, atbp.

SNP molecular labeling at detection1

Sa katawan ng tao, ang dalas ng SNP ay 0.1%.Sa madaling salita, mayroong isang average ng isang site ng SNP bawat 1000 base pairs.Bagama't medyo mataas ang dalas ng paglitaw, hindi lahat ng mga site ng SNP ay maaaring mga marker ng kandidato na nauugnay sa mga katangian.Pangunahing nauugnay ito sa lokasyon kung saan nangyayari ang SNP.

Sa teorya, ang SNP ay maaaring mangyari kahit saan sa pagkakasunud-sunod ng genome.Ang mga SNP na nagaganap sa rehiyon ng coding ay maaaring makagawa ng magkasingkahulugan na mga mutasyon at hindi magkasingkahulugan na mga mutasyon, iyon ay, ang amino acid ay nagbabago o hindi nagbabago bago at pagkatapos ng mutation.Ang binagong amino acid ay kadalasang nagiging sanhi ng pagkawala ng peptide chain sa orihinal nitong paggana (missense mutation), at maaari ring maging sanhi ng pag-abort ng pagsasalin (nonsense mutation).Ang mga SNP na nangyayari sa mga non-coding na rehiyon at mga intergenic na rehiyon ay maaaring makaapekto sa pag-splice ng mRNA, non-coding na komposisyon ng pagkakasunud-sunod ng RNA, at ang binding efficiency ng transcription factor at DNA.Ang partikular na relasyon ay ipinapakita sa figure:

Mga Uri ng SNP:

Pag-label at pagtuklas ng molekular ng SNP2

Ilang karaniwang paraan ng pag-type ng SNP at ang kanilang paghahambing

Ayon sa iba't ibang mga prinsipyo, ang mga karaniwang pamamaraan ng pagtuklas ng SNP ay nahahati sa mga sumusunod na kategorya:

Paghahambing ng pag-uuri ng mga paraan ng pagtuklas

SNP molecular labeling at detection3

Tandaan: Ang nakalista sa talahanayan ay kasalukuyang ginagamit na mas karaniwang mga paraan ng pag-detect ng SNP, ang iba pang mga paraan ng pag-detect gaya ng specific site hybridization (ASH), specific site primer extension (ASPE), single base extension (SBCE), specific site cutting (ASC), gene chip technology, mass spectrometry technology, atbp. ay hindi pa naiuri at naihambing.

Hindi maiiwasan ang gastos at oras ng paglilinis ng nucleic acid sa ilang karaniwang pamamaraan ng pagtuklas ng SNP.Gayunpaman, ang mga kaugnay na kit batay sa direktang teknolohiya ng PCR ng Foregene ay maaaring direktang magsagawa ng PCR o qPCR amplification sa mga hindi nalinis na sample, na nagdudulot ng hindi pa nagagawang kaginhawahan sa pagtuklas ng SNP.

Ang mga direktang PCR series na produkto ng Foregene ay simple at halos hindi inaalis ang mga hakbang sa pagdalisay ng sample, na lubos na nakakabawas sa oras at gastos na kinakailangan para sa paghahanda ng mga template.Ang natatanging Taq polymerase ay may mahusay na kakayahan sa amplification at kayang tiisin ang iba't ibang mga inhibitor mula sa mga kumplikadong kapaligiran ng amplification.Ang mga katangiang ito ay nagbibigay ng teknikal na garantiya para sa pagkuha ng mga partikular na produkto na may mataas na ani.Foregene Direct PCR/qPCR kit para sa iba't ibang uri ng sample, tulad ng: tissue ng hayop (buntot ng daga, zebrafish, atbp.), dahon ng halaman, buto (kabilang ang polysaccharides at polyphenol sample), atbp.


Oras ng post: Hul-23-2021